Etude in silico d'amorces de PCR

Univ Europeenne - EAN : 9786131535314

Julien Gardès

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Édition papier

EAN : 9786131535314

Paru le : 12 mars 2012

49,00 € 46,45 €

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Détails

EAN13 : 9786131535314
Réf. fournisseur : 5160173
Editeur : Univ Europeenne
Date Parution : 12 mars 2012
Disponibilite : Disponible
Barème de remise : NS
Nombre de pages : 124
Format : H:220 mm L:150 mm
Poids : 194gr
Interdit de retour : Retour interdit

Résumé

Résumé : Avec l'avènement des technologies basées sur l'ADN, les méthodes moléculaires de détection bactérienne (e.g. la Polymerase Chain Reaction (PCR)) sont progressivement en train de remplacer les méthodes de détection traditionnelles basées sur la culture cellulaire et la caractérisation biochimique de souches. Les amorces de PCR sont des petites séquences d'ADN qui vont permettre de cibler une région génétique à amplifier. La nature de leur séquence va donc conditionner la spécificité et la couverture (ou sensibilité) de la détection par PCR. Au cours de ma thèse, je me suis intéressé aux amorces de PCR qui ont été publiées dans la littérature scientifique. J'ai élaboré plusieurs procédures automatisées (pipelines) de bioinformatique pour (1) rechercher toutes les séquences d'un gène, (2) tous les articles scientifiques qui traitent de ce gène, (3) toutes les amorces PCR issues de cette littérature, et (4) vérifier leur efficacité, i.e. leur spécificité et leur couverture vis à vis de l'espèce bactérienne ciblée. Le site internet http://patho-genes.org regroupe tous les résultats et le logiciel (Oligomer-Extractor) qui ont été développés au cours de mes travaux.
Biographie : Je suis diplômé de l'École Normale Supérieure de Lyon en BioScience, où j'ai reçu une formation à la Recherche par la Recherche. Durant ces trois ans, j'ai découvert le domaine en pleine essor de la Bioinformatique, dans lequel je me suis spécialisé au cours de mon doctorat à l'Université de Nice - Sophia Antipolis dans l'équipe du Pr. R. Christen.