Didacticiel de reconstruction d'arbres phylogénétiques

Univ Europeenne - EAN : 9783841783035

Annick Chamontin

Skip to the end of the images gallery

Skip to the beginning of the images gallery

Édition papier

EAN : 9783841783035

Paru le : 9 déc. 2011

39,00 € 36,97 €

Disponible

Pour connaître votre prix et commander, identifiez-vous

Notre engagement qualité

Livraison gratuite
en France sans minimum
de commande
Manquants maintenus
en commande
automatiquement
Un interlocuteur
unique pour toutes
vos commandes
Toutes les licences
numériques du marché
au tarif éditeur
Assistance téléphonique
personalisée sur le
numérique
Service client
Du Lundi au vendredi
de 9h à 18h

Détails

EAN13 : 9783841783035
Réf. fournisseur : 5373510
Editeur : Univ Europeenne
Date Parution : 9 déc. 2011
Disponibilite : Disponible
Barème de remise : NS
Nombre de pages : 108
Format : H:220 mm L:150 mm
Poids : 170gr
Interdit de retour : Retour interdit

Résumé

Résumé : L'environnement didactique ISee permet une initiation aux techniques et algorithmes de la bioinformatique, comme la recherche de régions codantes dans les génomes. Dans ce contexte, un nouveau module destiné à expliquer les principes de la reconstruction algorithmique d'arbres phylogénétiques a été conçu et développé en Java. Un arbre phylogénétique rend compte de l'émergence des espèces au cours du temps et fait ainsi apparaître leur relation de parenté : deux espèces sont d'autant plus proches qu'elles sont apparues à partir d'une espèce ancestrale commune récente. Le nouveau module présente UPGMA, l'une des méthodes de reconstruction d'arbres phylogénétiques à partir de séquences génomiques d'espèces actuelles. Pour expliquer la méthode de reconstruction, le module affiche la matrice des distances entre les espèces, puis la construction de l'arbre, pas à pas, et ce de manière interactive. Le module présente aussi les hypothèses de base sur lesquelles repose la méthode de construction et en démontre les limites, à savoir l'hypothèse de l'horloge moléculaire et l'hypothèse que les séquences sont proches. Pour cela il offre trois interfaces, en libre exploration et expérimentation.
Biographie : Ingénieur C.N.A.M en Informatique. Réalisation du mémoire dans le laboratoire de recherche INRIA Rhône-Alpes à Montbonnot, au sein de l'équipe HELIX, en collaboration avec l'Ecole de l'ADN du CCSTI de Grenoble. Consultante système d'information, administrateur du progiciel SAP.